Al graduarse en la escuela secundaria, Rentarou Aijou consigue confesarse a la chica que ama. Desgraciadamente, es rechazado, lo que supone su 100º rechazo consecutivo. Tras sufrir un desengaño tras otro, acude a un santuario de casamenteros y reza con la esperanza de conseguir por fin una novia en el instituto. De repente, el dios del santuario aparece y promete a Rentarou que conocerá a cien almas gemelas en el instituto.
Aunque escéptico al principio, Rentarou reconoce rápidamente la verdad tras las palabras del dios cuando dos de sus almas gemelas -Hakari Hanazono y Karane Inda- se lo confiesan el mismo día en que lo conocen. Sin embargo, hay un detalle que el dios olvidó decirle a Rentarou: si alguna de sus almas gemelas no consigue entablar una relación con él, morirá. Atrapado en un asunto de vida o muerte, Rentarou decide salir con todas sus almas gemelas.
Con un corazón tan grande que puede repartirse entre cien amigas, Rentarou aprovecha al máximo su inesperada vida en el instituto, ¡y la familia Rentarou crece cada vez más!