
En un futuro lejano, los humanos abandonaron una Tierra devastada y viajaron al espacio exterior. Sin embargo, debido a un fenómeno desconocido que les impide viajar al espacio, la humanidad regresa a la Tierra sólo para encontrarla inhóspita excepto por Japón.
Para acomodar a toda la población humana, se crean dimensiones de bolsillo alrededor de Japón para albergar a la población. Con el fin de encontrar una manera de regresar al espacio exterior, los humanos comenzaron a recrear la historia humana según el libro sagrado del Testamento. Pero en el año 1413 de la Era Testamentaria, las naciones de las dimensiones de bolsillo invaden y conquistan Japón, dividiendo el territorio en feudos feudales y obligando a los habitantes originales de Japón a irse.
Es ahora el año 1648 de la Era Testamentaria, los refugiados de Japón viven ahora en la ciudad barco Musashi, donde viaja constantemente alrededor de Japón mientras es vigilado por la Unión Testamentaria, la autoridad que dirige la recreación de la historia. Sin embargo, los rumores de un apocalipsis y una guerra comienzan a extenderse cuando el Testamento deja de revelar lo que sucede después de 1648.
Aprovechando esta situación, Toori Aoi, jefe de la Federación Suprema de la Academia Musashi Ariadust y presidente del consejo estudiantil, lleva a sus compañeros de clase a aprovechar esta oportunidad para recuperar su patria.